Итоги лет деятельности свидетельствуют, что Счетная палата проводит эффективную работу по выявлению потерь финансовых ресурсов государства, возврату незаконно израсходованных средств, подготовке предложений по устранению причин существующих недостатков. Это позволяет заключить, что она стала инструментом, с помощью которого общество реально осуществляет пристрастный аудит своего государства.

Всего за 2000-2006 годы Счетная палата провела 3332 контрольных мероприятия (в 2000 году - 390, в 2006 году - 551).

В ходе контрольных мероприятий выявлено нарушений законодательства в финансово-бюджетной сфере на сумму 899,4 млрд. рублей (в 2000 году - 63,17 млрд. рублей, в 2006 - 82,3 млрд. рублей). За 2000 - 2006 годы в результате принятых мер устранено финансовых нарушений на сумму 59,6 млрд. рублей, из них в 2006 году - 1,2 млрд. рублей.

По результатам контрольных мероприятий в 2000-2006 годах Счетной палатой было направлено органам государственной власти, предприятиям и организациям 3191 представление и предписание. По выявленным фактам нарушения законодательства 531 материал был направлен в Генеральную прокуратуру Российской Федерации, возбуждено 1025 уголовных дел.

В 2000-2006 годах было проведено 321 заседаниe Коллегии Счетной палаты (в 2000 году - 44, в 2006 - 51). Рассмотрено 4509 вопросов (в 2000 году - 638, в 2006 - 736), в том числе 2610 - по результатам контрольных мероприятий (в 2000 году - 332, в 2006 - 376).

Отчеты о результатах всех контрольных мероприятий после утверждения Коллегией направляются в Совет Федерации и Государственную Думу Федерального Собрания. В обеих палатах Федерального Собрания созданы структуры по взаимодействию со Счетной палатой: комиссия в Совете Федерации, подкомитет в Государственной Думе.